Trở lại cao ốc Saigon One Tower, để có tiền thực hiện dự án này cũng như đầu tư các dự án khác, từ năm 2007-2013, ông Phùng Ngọc Khánh đặt vấn đề với ông Trần Phương Bình về việc sử dụng pháp nhân của 11 công ty do Khánh lập và 10 cá nhân khác để vay hơn 7.000 tỷ đồng từ Ngân hàng Đông Á.
Ông Trần Phương Bình cho rằng đây là dự án có tiềm năng nên đề nghị ông Khánh cho ngân hàng và cá nhân ông mua lại 21% cổ phần Cty CP Địa ốc Sài Gòn M&C.
Đến năm 2011, khi cao ốc xây dựng khoảng 80% khối lượng công việc thì "đắp chiếu" do ông Khánh và các đối tác không còn khả năng tài chính để xây tiếp.
Sau đó Ngân hàng Đông Á ký hợp đồng mua bán khoản nợ cho Cty Quản lý Tài sản (VAMC) với giá gần 680 tỷ đồng. Khoản nợ này có tài sản đảm bảo là một phần tài sản hình thành trong tương lai từ cao ốc Saigon One Tower (được định giá 723 tỷ đồng).
Năm 2018, VAMC thông báo bán đấu giá cao ốc này để xử lý khoản nợ xấu.
Ngoài ra, một dự án khác cũng đang "đắp chiếu", hiện làm bãi giữ xe ở trung tâm TPHCM là dự án ở khu đất vàng số 8-12 Lê Duẩn (quận 1).
Năm 2008, UBND TPHCM có quyết định thu hồi nhà đất tại địa chỉ này để thực hiện dự án xây dựng khách sạn cao cấp. Đây là dự án đã bị Cty TNHH Hoa Tháng Năm do bà Lê Thị Thanh Thúy (Chủ tịch HĐQT) thâu tóm.
Bà Lê Thị Thanh Thúy sau đó bị bắt. Trước đó ông Nguyễn Thành Tài (Cựu Phó Chủ tịch UBND TPHCM) cùng một số quan chức cấp dưới khác có liên quan cũng bị bắt tạm giam để điều tra liên quan đến những sai phạm xảy ra ở dự án này.