Việc sử dụng hóa đơn điện tử có nhiều thuận lợi như giảm chi phí và thời gian trong việc in, phát hành, gửi và lưu giữ hóa đơn giấy, đồng thời hạn chế việc làm giả hóa đơn.
Theo ước tính sơ bộ của Tổng cục Thuế , DN sử dụng hóa đơn giấy trung bình phải bỏ chi phí trên 1.000 đồng/hóa đơn và với số lượng 2,5 tỉ hóa đơn/năm thì chi phí mỗi năm bỏ ra lên đến 2.500 tỉ đồng. Trong khi đó nếu sử dụng hóa đơn điện tử, số tiền mà DN có thể tiết kiệm được tới trên 1.000 tỉ đồng/năm.
Bộ Tài chính đã trình Chính phủ dự thảo sửa đổi nghị định về hóa đơn điện tử. Nội dung chủ yếu của dự thảo là hóa đơn điện tử sẽ được áp dụng bắt buộc đối với DN, tổ chức, cơ quan nhà nước, kể cả cơ quan có chức năng kiểm tra, quản lý thị trường.