Nguồn rau quả nhập khẩu lớn nhất là từ Thái Lan (chiếm 46,5% thị phần), tiếp đến là Trung Quốc (chiếm 19,6%).
Trái cây từ các nước Âu, Mỹ chủ yếu nhập chính ngạch nên có đầy đủ giấy tờ kiểm soát chất lượng, truy xuất nguồn gốc song lại có giá thành cao. Ví dụ kiwi vàng của New Zealand, táo Envy của New Zealand khi về Việt Nam có giá bán hàng trăm ngàn đồng/kg. Thậm chí có những trái vốn là loại bình dân, mọc dại ở nước ngoài nhưng được thị trường trong nước yêu thích và bán giá cao, điển hình là cherry.
Đáng chú ý, một lượng lớn trái cây nhiệt đới mà Việt Nam trồng rất nhiều như sầu riêng, chôm chôm, cam, quýt, măng cụt... cũng được nhập khẩu từ Thái Lan, Indonesia, Ấn Độ, Malaysia, Trung Quốc ...
Điều bất hợp lý là trong khi trái cây chất lượng cao của Việt Nam dành để xuất khẩu thì người tiêu dùng trong nước lại phải trả giá cao để mua các loại trái cây nhập ngoại cùng loại. Một trong những nguyên nhân dẫn đến tình trạng trên là các doanh nghiệp chỉ chú trọng thị trường nước ngoài mà chưa chú trọng đến thị trường trong nước.